MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002679	CGA	2	6	155923	155928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2502	NC_002679	GTT	2	6	155933	155938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488111
2503	NC_002679	CGA	2	6	155959	155964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2504	NC_002679	CGGG	2	8	156061	156068	0 %	0 %	75 %	25 %	13488111
2505	NC_002679	GGC	2	6	156072	156077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2506	NC_002679	CGG	2	6	156082	156087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2507	NC_002679	CCA	2	6	156217	156222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488111
2508	NC_002679	AAG	2	6	156223	156228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488111
2509	NC_002679	GCG	2	6	156235	156240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2510	NC_002679	GAG	2	6	156381	156386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488111
2511	NC_002679	ACC	2	6	156426	156431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488111
2512	NC_002679	GCG	2	6	156447	156452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2513	NC_002679	CGGA	2	8	156496	156503	25 %	0 %	50 %	25 %	13488111
2514	NC_002679	AGG	2	6	156508	156513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488111
2515	NC_002679	GCG	2	6	156543	156548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2516	NC_002679	GAG	2	6	156552	156557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488111
2517	NC_002679	GCA	2	6	156571	156576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2518	NC_002679	GTC	2	6	156626	156631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2519	NC_002679	GCT	2	6	156760	156765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2520	NC_002679	TCG	3	9	156771	156779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2521	NC_002679	GGC	2	6	156805	156810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
2522	NC_002679	CGT	2	6	156811	156816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
2523	NC_002679	GTTCG	2	10	156830	156839	0 %	40 %	40 %	20 %	13488111
2524	NC_002679	TCGCA	2	10	156892	156901	20 %	20 %	20 %	40 %	13488111
2525	NC_002679	TCGA	2	8	156958	156965	25 %	25 %	25 %	25 %	13488111
2526	NC_002679	TTGC	2	8	157138	157145	0 %	50 %	25 %	25 %	13488229
2527	NC_002679	CGT	2	6	157242	157247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488229
2528	NC_002679	CGA	2	6	157271	157276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488229
2529	NC_002679	GGC	2	6	157310	157315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488229
2530	NC_002679	CCA	2	6	157366	157371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488229
2531	NC_002679	CGA	2	6	157381	157386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488229
2532	NC_002679	G	6	6	157401	157406	0 %	0 %	100 %	0 %	13488229
2533	NC_002679	CCG	2	6	157439	157444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488229
2534	NC_002679	CGCC	2	8	157735	157742	0 %	0 %	25 %	75 %	13488229
2535	NC_002679	CCGC	2	8	157750	157757	0 %	0 %	25 %	75 %	13488229
2536	NC_002679	CGAAC	2	10	157780	157789	40 %	0 %	20 %	40 %	13488229
2537	NC_002679	GC	3	6	157920	157925	0 %	0 %	50 %	50 %	13488229
2538	NC_002679	ACG	2	6	157996	158001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488229
2539	NC_002679	CG	4	8	158120	158127	0 %	0 %	50 %	50 %	13488229
2540	NC_002679	AGAT	2	8	158224	158231	50 %	25 %	25 %	0 %	13488330
2541	NC_002679	CGA	2	6	158240	158245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488330
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2545	NC_002679	AAT	2	6	158349	158354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488330
2546	NC_002679	TGC	2	6	158521	158526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488230
2547	NC_002679	ATG	2	6	158527	158532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488230
2548	NC_002679	CAT	2	6	158546	158551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488230
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2550	NC_002679	GGC	2	6	158592	158597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
2551	NC_002679	AG	3	6	158829	158834	50 %	0 %	50 %	0 %	13488230
2552	NC_002679	GGA	2	6	158837	158842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488230
2553	NC_002679	ACT	2	6	158848	158853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488230
2554	NC_002679	CGC	2	6	159062	159067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488230
2555	NC_002679	GCT	2	6	159099	159104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488230
2556	NC_002679	GA	3	6	159110	159115	50 %	0 %	50 %	0 %	13488230
2557	NC_002679	CAG	2	6	159198	159203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488230
2558	NC_002679	GCA	2	6	159246	159251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488230
2559	NC_002679	CGGAA	2	10	159255	159264	40 %	0 %	40 %	20 %	13488230
2560	NC_002679	TCCT	2	8	159313	159320	0 %	50 %	0 %	50 %	13488230
2561	NC_002679	GGCCGG	2	12	159323	159334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
2562	NC_002679	TGA	2	6	159364	159369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488230
2563	NC_002679	CGG	2	6	159439	159444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
2564	NC_002679	GAA	2	6	159486	159491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488230
2565	NC_002679	CG	3	6	159494	159499	0 %	0 %	50 %	50 %	13488230
2566	NC_002679	GCG	2	6	159503	159508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
2567	NC_002679	TCGA	2	8	159513	159520	25 %	25 %	25 %	25 %	13488230
2568	NC_002679	GTGGC	2	10	159598	159607	0 %	20 %	60 %	20 %	13488230
2569	NC_002679	CAT	2	6	159620	159625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488230
2570	NC_002679	GCG	2	6	159647	159652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
2571	NC_002679	GCT	2	6	160328	160333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488112
2572	NC_002679	CGA	2	6	160515	160520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488112
2573	NC_002679	CGAG	2	8	160603	160610	25 %	0 %	50 %	25 %	13488112
2574	NC_002679	TCC	2	6	160625	160630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488112
2575	NC_002679	GCA	2	6	160766	160771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488112
2576	NC_002679	TCA	2	6	160794	160799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488112
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2578	NC_002679	GGAAG	2	10	160875	160884	40 %	0 %	60 %	0 %	13488112
2579	NC_002679	GGC	2	6	160885	160890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488112
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2581	NC_002679	AGAA	2	8	160940	160947	75 %	0 %	25 %	0 %	13488112
2582	NC_002679	TGC	2	6	160952	160957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488112
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2584	NC_002679	CCA	2	6	160983	160988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488112
2585	NC_002679	TCAT	2	8	161040	161047	25 %	50 %	0 %	25 %	13488112
2586	NC_002679	CGGC	2	8	161252	161259	0 %	0 %	50 %	50 %	13488113
2587	NC_002679	CGG	2	6	161337	161342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488113
2588	NC_002679	CAC	2	6	161354	161359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488113
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2590	NC_002679	GGC	2	6	161397	161402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488113
2591	NC_002679	GCA	2	6	161515	161520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488113
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2593	NC_002679	GAC	2	6	161561	161566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488113
2594	NC_002679	GCT	2	6	161576	161581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488113
2595	NC_002679	CG	3	6	161614	161619	0 %	0 %	50 %	50 %	13488113
2596	NC_002679	GTCC	2	8	161626	161633	0 %	25 %	25 %	50 %	13488113
2597	NC_002679	CGA	2	6	161659	161664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488113
2598	NC_002679	GCG	2	6	161666	161671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488113
2599	NC_002679	GC	3	6	161725	161730	0 %	0 %	50 %	50 %	13488113
2600	NC_002679	CG	3	6	161815	161820	0 %	0 %	50 %	50 %	13488113
2601	NC_002679	TGTCGG	2	12	162025	162036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13488113
2602	NC_002679	CGT	2	6	162070	162075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488113
2603	NC_002679	CAC	2	6	162101	162106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488113
2604	NC_002679	CGA	2	6	162109	162114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488113
2605	NC_002679	GC	3	6	162216	162221	0 %	0 %	50 %	50 %	13488113
2606	NC_002679	CCG	2	6	162222	162227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488113
2607	NC_002679	GAT	2	6	162232	162237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488113
2608	NC_002679	GGT	2	6	162281	162286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488113
2609	NC_002679	TGCGT	2	10	162310	162319	0 %	40 %	40 %	20 %	13488113
2610	NC_002679	CGG	2	6	162322	162327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488113
2611	NC_002679	TGT	2	6	162382	162387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488113
2612	NC_002679	CT	3	6	162481	162486	0 %	50 %	0 %	50 %	13488113
2613	NC_002679	ATG	2	6	162521	162526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488113
2614	NC_002679	GCC	2	6	162527	162532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488113
2615	NC_002679	GATA	2	8	162535	162542	50 %	25 %	25 %	0 %	13488113
2616	NC_002679	GTT	2	6	162565	162570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488113
2617	NC_002679	CGG	2	6	162571	162576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488113
2618	NC_002679	GCA	2	6	162638	162643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488114
2619	NC_002679	CGG	2	6	162746	162751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488114
2620	NC_002679	CAT	2	6	162809	162814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488114
2621	NC_002679	CAG	2	6	162822	162827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488114
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2623	NC_002679	CAG	3	9	162921	162929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488114
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2747	NC_002679	GTC	2	6	172688	172693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
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2865	NC_002679	TCGGTT	2	12	181073	181084	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	13488369
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2991	NC_002679	ACA	2	6	190514	190519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488240
2992	NC_002679	CGA	2	6	190557	190562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488240
2993	NC_002679	TGC	2	6	190577	190582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488240
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